MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanosarcina acetivorans C2A chromosome

Total Repeats: 112404

< Previous12345678910111213...224225Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_003552	AGC	2	6	101432	101437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	20088982
2002	NC_003552	AAG	2	6	101513	101518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088982
2003	NC_003552	AAG	2	6	101544	101549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088982
2004	NC_003552	ATGC	2	8	101675	101682	25 %	25 %	25 %	25 %	20088982
2005	NC_003552	GAG	2	6	101687	101692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	20088982
2006	NC_003552	AGA	2	6	101724	101729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	20088982
2007	NC_003552	CTT	2	6	101851	101856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2008	NC_003552	CCCG	2	8	101950	101957	0 %	0 %	25 %	75 %	20088983
2009	NC_003552	TTC	3	9	102003	102011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088983
2010	NC_003552	CTT	2	6	102071	102076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088983
2011	NC_003552	CAT	2	6	102143	102148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20088983
2012	NC_003552	GGT	2	6	102161	102166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	20088983
2013	NC_003552	CTT	2	6	102203	102208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088983
2014	NC_003552	TTC	2	6	102397	102402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088983
2015	NC_003552	TCTT	2	8	102454	102461	0 %	75 %	0 %	25 %	20088983
2016	NC_003552	TC	4	8	102517	102524	0 %	50 %	0 %	50 %	20088983
2017	NC_003552	AGG	2	6	102544	102549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	20088983
2018	NC_003552	TCGTGT	2	12	102556	102567	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	20088983
2019	NC_003552	GGTA	2	8	102570	102577	25 %	25 %	50 %	0 %	20088983
2020	NC_003552	CTC	2	6	102629	102634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20088983
2021	NC_003552	TTA	2	6	102700	102705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	20088983
2022	NC_003552	TGC	3	9	102714	102722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	20088983
2023	NC_003552	CAA	2	6	102839	102844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	20088983
2024	NC_003552	TTCTT	2	10	102885	102894	0 %	80 %	0 %	20 %	20088983
2025	NC_003552	T	7	7	102893	102899	0 %	100 %	0 %	0 %	20088983
2026	NC_003552	TTC	2	6	102924	102929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088983
2027	NC_003552	TTC	2	6	102948	102953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088983
2028	NC_003552	T	6	6	102968	102973	0 %	100 %	0 %	0 %	20088983
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2030	NC_003552	GGT	2	6	103003	103008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	20088983
2031	NC_003552	CTT	2	6	103063	103068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088983
2032	NC_003552	T	6	6	103067	103072	0 %	100 %	0 %	0 %	20088983
2033	NC_003552	T	7	7	103077	103083	0 %	100 %	0 %	0 %	20088983
2034	NC_003552	T	6	6	103088	103093	0 %	100 %	0 %	0 %	20088983
2035	NC_003552	A	6	6	103156	103161	100 %	0 %	0 %	0 %	20088983
2036	NC_003552	TAT	2	6	103250	103255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	20088983
2037	NC_003552	TTC	2	6	103257	103262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088983
2038	NC_003552	T	7	7	103279	103285	0 %	100 %	0 %	0 %	20088983
2039	NC_003552	AGG	2	6	103369	103374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	20088983
2040	NC_003552	CTT	2	6	103394	103399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088983
2041	NC_003552	CTC	2	6	103400	103405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20088983
2042	NC_003552	TCC	2	6	103462	103467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	20088983
2043	NC_003552	AAAAT	2	10	103638	103647	80 %	20 %	0 %	0 %	20088983
2044	NC_003552	T	6	6	103654	103659	0 %	100 %	0 %	0 %	20088983
2045	NC_003552	T	6	6	103667	103672	0 %	100 %	0 %	0 %	20088983
2046	NC_003552	CTTT	2	8	103705	103712	0 %	75 %	0 %	25 %	20088983
2047	NC_003552	GA	3	6	103721	103726	50 %	0 %	50 %	0 %	20088983
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2050	NC_003552	T	6	6	103889	103894	0 %	100 %	0 %	0 %	20088983
2051	NC_003552	CT	3	6	103945	103950	0 %	50 %	0 %	50 %	20088983
2052	NC_003552	GAG	2	6	103968	103973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	20088983
2053	NC_003552	T	6	6	104046	104051	0 %	100 %	0 %	0 %	20088983
2054	NC_003552	AGAT	2	8	104083	104090	50 %	25 %	25 %	0 %	20088983
2055	NC_003552	T	7	7	104104	104110	0 %	100 %	0 %	0 %	20088983
2056	NC_003552	TAA	2	6	104150	104155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	20088983
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2058	NC_003552	TTC	2	6	104259	104264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088983
2059	NC_003552	TC	3	6	104263	104268	0 %	50 %	0 %	50 %	20088983
2060	NC_003552	CGG	2	6	104330	104335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	20088983
2061	NC_003552	ATA	2	6	104352	104357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	20088983
2062	NC_003552	ATA	2	6	104368	104373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	20088983
2063	NC_003552	T	6	6	104380	104385	0 %	100 %	0 %	0 %	20088983
2064	NC_003552	AAGC	2	8	104441	104448	50 %	0 %	25 %	25 %	20088983
2065	NC_003552	GA	3	6	104452	104457	50 %	0 %	50 %	0 %	20088983
2066	NC_003552	TTC	2	6	104481	104486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	20088983
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2068	NC_003552	GTC	2	6	104672	104677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2069	NC_003552	GCTTAA	2	12	104694	104705	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2070	NC_003552	ATC	2	6	104727	104732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2072	NC_003552	TAG	2	6	104864	104869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2073	NC_003552	TAA	2	6	104917	104922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2074	NC_003552	TTA	2	6	104930	104935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2075	NC_003552	TTAT	2	8	104979	104986	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2076	NC_003552	ACTC	2	8	105047	105054	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2077	NC_003552	ATTAA	2	10	105060	105069	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2078	NC_003552	A	7	7	105208	105214	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2093	NC_003552	T	6	6	106443	106448	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2094	NC_003552	A	7	7	106518	106524	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2097	NC_003552	GA	4	8	106568	106575	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2098	NC_003552	T	6	6	106601	106606	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2099	NC_003552	CAT	2	6	106736	106741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	20088985
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2499	NC_003552	TTC	2	6	127281	127286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2500	NC_003552	A	6	6	127303	127308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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